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立体结构差异

椅式环己烷结构中，碳原子构成的环近似于一个三维的椅子形状。在这个结构里，每个碳原子上的氢原子（或其他取代基）之间的空间位阻比较小。因为它们分布在相互错开的位置，就像椅子的腿和椅背的横档一样，彼此之间不会过于拥挤。

船式环己烷结构呈船形。在船式结构中，船头和船尾部分的氢原子（或取代基）距离较近，会产生较大的空间位阻，这些原子或者基团之间相互挤压，导致结构内部能量升高，稳定性降低。

扭转张力不同

椅式结构的碳 - 碳键扭转角比较合适，扭转张力较小。简单来说，相邻的碳 - 碳键旋转产生的能量消耗少，使得整个结构处于能量较低的稳定状态。

船式结构存在较大的扭转张力。尤其是在船头和船尾部分的碳 - 碳键扭转角度不合适，产生了较大的能量累积，就像被扭曲的弹簧一样，这种能量使结构不稳定。